MetagenomeDB adalah perpustakaan Python dirancang untuk mudah menyimpan, mengambil dan keterangan urutan metagenomic & nbsp;. MetagenomeDB bertindak sebagai lapisan abstraksi di atas database MongoDB. Ini menyediakan API untuk membuat dan memodifikasi dan...
SSuMMo adalah perpustakaan fungsi dirancang di sekitar iteratif menggunakan hmmer untuk menetapkan urutan ke taksa & nbsp;. Hasil pohon yang sangat dijelaskan menunjukkan spesies / distribusi genus dalam komunitas itu.Program yang disertakan dengan kode...
tigreBrowser adalah ekspresi gen Model Browser untuk hasil dari paket R tigre (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Instalasi: tigreBrowser membutuhkan Python versi> = 2.5. tigreBrowser dapat diinstal dengan perintah...
MACS2 adalah alat analisis berbasis model untuk data CHIP-Seq.Dengan perbaikan teknik sequencing, kromatin immunoprecipitation diikuti oleh sekuensing throughput yang tinggi (CHIP-Seq) semakin populer untuk mempelajari interaksi protein-DNA genome-wide....
edittag adalah koleksi aplikasi untuk merancang set mengedit tag urutan metrik, memeriksa tag urutan untuk konformasi ke mengedit metrik, dan mengintegrasikan tag urutan ke adapter sequencing-platform tertentu dan PCR primer. edittag berbeda dari...
MacMolPlt adalah program grafis modern untuk merencanakan struktur molekul 3-D dan mode normal (getaran). Sarana...
picme adalah paket Python yang berisi program untuk memperkirakan dan merencanakan informativeness filogenetik untuk dataset besar. Instalasi Untuk saat ini, cara termudah untuk menginstal program ini adalah:git clone git:...
SyntenyMiner adalah aplikasi untuk memvisualisasikan dan menginterogasi perbandingan antara beberapa urutan genom lengkap. Antarmuka memberikan pandangan dilayari pertandingan ke urutan genom referensi. Urutan pertandingan antara kromosom dari genom yang...
ProteinShop adalah alat interaktif untuk memanipulasi struktur protein. Ini dirancang untuk segera membuat satu set konfigurasi protein menggunakan pengetahuan manusia dan intuisi. Konfigurasi ini dapat dikenakan optimasi lokal atau global. Meskipun...
PySCeS adalah proyek yang dikembangkan oleh Triple-J Group untuk Cell Molecular Physiology & nbsp;. Dalam rangka untuk mencoba Model dan memahami proses kompleks dan sistem yang membentuk sel hidup Fitur :. Sebuah berbasis teks bahasa deskripsi...
