ProteinShop adalah alat interaktif untuk memanipulasi struktur protein. Ini dirancang untuk segera membuat satu set konfigurasi protein menggunakan pengetahuan manusia dan intuisi. Konfigurasi ini dapat dikenakan optimasi lokal atau global. Meskipun...
pyNetConv adalah perpustakaan Python diciptakan untuk membantu konversi dari beberapa format file jaringan.Sejak versi 0.6, pyNetConv mampu membaca / menulis (dan mengkonversi dari / ke) format file...
Pysam adalah modul Python untuk membaca dan memanipulasi Samfiles & nbsp;. Ini pembungkus ringan dari samtools C-API.Panduan memulai cepat di sini. Dokumentasi yang lebih rinci tersedia di sini.Pertanyaan dan komentar yang sangat welcome dan harus dikirim...
PySCeS adalah proyek yang dikembangkan oleh Triple-J Group untuk Cell Molecular Physiology & nbsp;. Dalam rangka untuk mencoba Model dan memahami proses kompleks dan sistem yang membentuk sel hidup Fitur :. Sebuah berbasis teks bahasa deskripsi...
reciprocal_smallest_distance adalah algoritma orthology berpasangan yang menggunakan keselarasan urutan global dan kemungkinan maksimum jarak evolusi antara urutan untuk secara akurat mendeteksi orthologs antara genom. Menginstall Dari Tarbal Download dan...
perencana RFLP adalah alat yang membantu untuk merencanakan eksperimen RFLP: Ini menemukan enzim restriksi yang memotong satu set urutan DNA homolog dengan cara yang berbeda dan mensimulasikan gambar elektroforesis gel- yang dihasilkan. Program ini...
Seal adalah modul Python yang menyediakan urutan keselarasan pada Hadoop.Seal adalah aplikasi MapReduce untuk biologi urutan keselarasan. Ini berjalan pada Hadoop (http://hadoop.apache.org) melalui Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), Python MapReduce...
seriesoftubes adalah pipa diperpanjang untuk Solexa Data CHIP-seq.Dokumentasi paket Persyaratan : ...
Membangun sistem seperti make sering digunakan untuk membuat alur kerja yang rumit, misalnya dalam bioinformatika & nbsp;. snakemake bertujuan untuk mengurangi kompleksitas menciptakan alur kerja dengan menyediakan bersih dan modern domain yang spesifik...
SSuMMo adalah perpustakaan fungsi dirancang di sekitar iteratif menggunakan hmmer untuk menetapkan urutan ke taksa & nbsp;. Hasil pohon yang sangat dijelaskan menunjukkan spesies / distribusi genus dalam komunitas itu.Program yang disertakan dengan kode...
