LANGKAH adalah paket untuk simulasi stokastik yang tepat dari sistem reaksi-difusi dalam geometri 3D sewenang-wenang kompleks. Algoritma simulasi inti kami adalah implementasi Gillespie SSA, diperluas untuk menangani difusi molekul atas unsur-unsur mesh...
NEO (Neural Ensemble Objects) dan merupakan proyek untuk menyediakan seperangkat kelas dasar yang akan digunakan dalam analisis data saraf, dengan tujuan mendapatkan OpenElectrophy, NeuroTools dan proyek lainnya mungkin dengan tujuan yang sama lebih dekat...
OpenElectrophy adalah suatu kerangka kerja untuk memfasilitasi manipulasi, penyimpanan dan analisis data elektrofisiologi. Hal ini dapat mengimpor data dari berbagai format file dan menyimpannya dalam database SQL-jenis tunggal.Alat analisis yang termasuk...
PEAT adalah paket program untuk menangkap, memprediksi dan menganalisis karakteristik biofisik protein.Lihat http://enzyme.ucd.ie/PEAT untuk dokumentasi, petunjuk, screenshot dll Persyaratan :. ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) adalah program yang efisien yang sejalan urutan nukleotida yang relatif singkat terhadap urutan referensi panjang seperti genom manusia.Perangkat lunak ini mengimplementasikan dua algoritma, BWA pendek dan BWA-SW. Mantan...
SSuMMo adalah perpustakaan fungsi dirancang di sekitar iteratif menggunakan hmmer untuk menetapkan urutan ke taksa & nbsp;. Hasil pohon yang sangat dijelaskan menunjukkan spesies / distribusi genus dalam komunitas itu.Program yang disertakan dengan kode...
goby adalah API Python untuk membaca file data biner yang dibuat dengan menggunakan Goby next-gen kerangka kerja manajemen data.Biasanya, direktori ini datang sebagai bagian dari paket Goby lengkap, tersedia dari:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Paket...
PySCeS adalah proyek yang dikembangkan oleh Triple-J Group untuk Cell Molecular Physiology & nbsp;. Dalam rangka untuk mencoba Model dan memahami proses kompleks dan sistem yang membentuk sel hidup Fitur :. Sebuah berbasis teks bahasa deskripsi...
Pysam adalah modul Python untuk membaca dan memanipulasi Samfiles & nbsp;. Ini pembungkus ringan dari samtools C-API.Panduan memulai cepat di sini. Dokumentasi yang lebih rinci tersedia di sini.Pertanyaan dan komentar yang sangat welcome dan harus dikirim...
TRMiner adalah utilitas Python yang bertujuan kurator data ilmiah & nbsp;. Hal ini memungkinkan untuk cepat memangkas koleksi besar publikasi ilmiah untuk kalimat yang relevan untuk tujuan pertambangan yang diberikan.Hal ini dicapai dalam dua langkah....
