CWC Simulator

CWC Simulator adalah C ++ pelaksanaan KSK, kalkulus untuk representasi dan simulasi sistem biologis & nbsp;. Setelah instalasi berhasil (lihat INSTALL) Anda akan dapat menjalankan simulasi atas model CWC, seperti yang ditunjukkan dalam beberapa contoh (lihat contoh /).
(Command-line) Antarmuka
Sebagai pengguna umum, Anda harus menjalankan:

model.cwc -i
-o
-t
-s
n
-c
--qt-batas
q
w
Dimana:
- adalah nama executable (default: scwc);
& Nbsp; - model.cwc adalah masukan Program CWC (lihat contoh);
& Nbsp; - statistik adalah output-file awalan;
& Nbsp; - adalah batas simulasi-waktu;
& Nbsp; - adalah periode sampling (yaitu 0,12 untuk mendapatkan 250 poin dengan batas waktu = 30);
& Nbsp; - adalah jumlah contoh simulasi;
& Nbsp; - adalah jumlah cluster untuk k-means
& Nbsp; - adalah ambang batas untuk QT pengelompokan
& Nbsp; - adalah jumlah quantiles;
& Nbsp; - memiliki biasanya sesuai dengan jumlah core dari sistem anda (yaitu 4 untuk quad-core CPU).
Keluaran
Alat ini menghasilkan:
- Beberapa file dat (output sampel dari simulasi)
- Beberapa script gnuplot untuk menarik melakukan analisa statistik
Kami sedang bekerja di sebuah manual yang komprehensif

Fitur :.

• algoritma Gillespie SSA lebih model CWC
• Hybrid stochastic / semantik deterministik
• Beberapa contoh simulasi dengan statistik online
• Optimization untuk arsitektur multicore berdasarkan kerangka FastFlow
• kerangka statistik Extensible (mean-variance, disaring pengelompokan dll.)
• Beberapa semantik rating (aksi massa, Michaelis-Menten, Bukit dll.)