Command line tool untuk membandingkan dipisahkan koma file data menggunakan perbedaan relatif untuk menentukan konformasi paling mirip. Compsortall membandingkan file data menggunakan perbedaan relatif, menghitung skor kesamaan, macam nilai dari inti dalam urutan (nilai yang lebih rendah merupakan kesamaan yang lebih besar), menyimpan semua nilai dalam sebuah file teks. File-file data yang dihasilkan oleh pengguna, harus koma file teks delimited. Setiap file merupakan molekul yang unik. Setiap baris dalam file merupakan konformasi yang unik dari molekul. Kolom pertama dalam file data harus label unik untuk konformasi diwakili oleh baris. Sisa kolom deskripsi numerik, seperti pengukuran jarak ruang. Baris dibandingkan combinatorially antara file. Label dibandingkan akan digabungkan dan disimpan dengan skor untuk set baris. Ini menyediakan cara untuk mengidentifikasi konformasi yang menghasilkan skor kesamaan tertentu.
Masa Depan kerja meliputi:
menambahkan
antarmuka GUI
postingan kertas saya 3D pharmacophore algoritma pemodelan
Sebuah versi paralel menggunakan MPI
Apa yang baru dalam rilis ini:
- output layar Berubah untuk menggabungkan lalu dan menulis siklus lebih akurat mencerminkan jumlah baris digabung dan tertulis.
- kesalahan ejaan tetap.
- perubahan Sedikit dalam kode sumber komentar dan nama variabel untuk meningkatkan keterbacaan
Persyaratan :.
Mac OS X 10.3
Komentar tidak ditemukan