Command line tool untuk membandingkan dipisahkan koma file data menggunakan perbedaan relatif untuk menentukan konformasi paling mirip. Compsort membandingkan file data menggunakan perbedaan relatif, menghitung skor kesamaan, macam nilai dalam urutan menaik (nilai yang lebih rendah merupakan kesamaan yang lebih besar), menyimpan sejumlah X skor rendah.
File-file data yang dihasilkan oleh pengguna, harus koma file teks delimited. Setiap file merupakan molekul yang unik. Setiap baris dalam file merupakan konformasi yang unik dari molekul. Kolom pertama dalam file data harus label unik untuk konformasi diwakili oleh baris. Sisa kolom deskripsi numerik, seperti pengukuran jarak ruang.
Baris dibandingkan combinatorially antara file. Label dibandingkan akan digabungkan dan disimpan dengan skor untuk set baris. Ini menyediakan cara untuk mengidentifikasi konformasi yang menghasilkan skor kesamaan tertentu.
Masa Depan kerja meliputi:
- menambahkan antarmuka GUI
- postingan kertas algoritma pemodelan 3D pharmacophore saya
- Sebuah versi paralel menggunakan MPI
Apa yang baru dalam rilis ini:
- tetap beberapa minor peringatan compiler
- menambahkan pelaporan perhitungan waktu untuk mengatur perhitungan kombinasi selain waktu semacam dilaporkan sebelumnya
- peningkatan tingkat optimasi compiler dari biner
Persyaratan :
Mac OS X 10.3
Komentar tidak ditemukan