Ghemical

Ghemical adalah paket perangkat lunak kimia komputasi dirilis di bawah GNU GPL. Ini berarti bahwa kode sumber penuh paket tersedia, dan pengguna bebas untuk mempelajari dan memodifikasi paket. Ghemical ditulis dalam C ++.
Proyek Ghemical memiliki antarmuka pengguna grafis (yang didasarkan pada GNOME), dan mendukung kedua kuantum mekanik (semi-empiris dan ab initio) model dan mekanik model molekul (ada Tripos medan kekuatan 5.2-seperti eksperimental untuk molecu organik juga alat untuk mengurangi model protein [1] disertakan. optimasi Geometri, dinamika molekul dan satu set besar alat visualisasi saat ini tersedia.
Ghemical bergantung pada kode eksternal untuk memberikan perhitungan kuantum mekanik. Metode semi-empiris MNDO, Mindo / 3, AM1 dan PM3 berasal dari paket MOPAC7 (Public Domain), dan termasuk dalam distribusi sumber.
Paket MPQC (GNU GPL) digunakan untuk menyediakan metode ab initio: metode didasarkan pada teori Hartree-Fock yang saat ini didukung dengan basis set mulai dari STO-3G untuk 6-31G **.
Kode MPQC tidak termasuk dalam distribusi sumber. Dalam rangka untuk menggunakan ab initio MPQC berbasis metode dalam Ghemical, Anda harus terlebih dahulu mengkompilasi dan menginstal program MPQC untuk sistem Anda, dan kemudian kompilasi Ghemical menggunakan beberapa pengaturan khusus yang menghubungkan program bersama-sama; melihat file INSTALL untuk informasi lebih lanjut. Ghemical juga berisi paket OpenBabel untuk impor dan ekspor berbagai format file (serta tugas-tugas lainnya).
Instalasi
Setelah Anda download rilis terbaru, Anda harus ekstrak semua file dari file arsip Anda menggunakan "tar -zxvvf ghemical-1.00.tgz" atau ekuivalen "gunzip ghemical-1.00.tgz; tar -xvvf ghemical-1.00.tar". Setelah itu silahkan baca "INSTALL"-file Anda hanya diekstrak untuk mendapatkan informasi tambahan.
Apa yang Baru di Release ini: