Arabidopsis Motif Scanner (AMS) adalah sebuah aplikasi Windows yang berjalan pada komputer lokal. Ini dikembangkan untuk membangun jaringan gen dengan mengidentifikasi posisi elemen cis-peraturan dalam tanaman model Arabidopsis thaliana dan dengan menyediakan antarmuka yang mudah untuk menilai dan mengevaluasi hubungan gen. Its fitur inovatif utama adalah untuk menggabungkan posisi elemen cis-peraturan, NGS dan DNA Chip Array ekspresi data, penjelasan Arabidopsis dan interaksi gen untuk identifikasi jaringan gen diatur oleh faktor transkripsi. Dalam penelitian difokuskan pada fungsi faktor transkripsi, software menggunakan data ekspresi dan mengikat motif situs di daerah gen regulatif untuk memprediksi gen target langsung. Selain itu, AMS menggunakan DNA-protein dan interaksi proteinprotein data untuk memfasilitasi identifikasi jalur metabolisme diatur oleh faktor transkripsi yang menarik.
Komentar tidak ditemukan