MacMolPlt

MacMolPlt adalah alat visualisasi Kimia yang dapat digunakan untuk membangun molekul dengan pembangun model grafis terintegrasi, membuat file masukan untuk program kimia komputasi GAMESS, dan kemudian memvisualisasikan hasil komputasi kimia berjalan. Fitur termasuk tampilan 3D berkualitas tinggi, animasi mode normal dan urutan reaksi dan output ke berbagai format termasuk gambar berkualitas tinggi dan QuickTime dan Flash film.

• Masukan menggunakan:
• format file MolPlt menekan oleh GAMESS
• dengan menyisipkan dalam koordinat Cartesian dari setiap GAMESS atau Gaussian File log
• input GAMESS, log atau berkas irc
• Xmol file gaya XYZ
• format file Molden
• Protein Data Bank (PDB ) mengajukan
• Kimia Markup Language (CML) file
• Membangun grafis dengan editor molekul interaktif
• Membangun dengan tangan menggunakan koordinat internal yang gaya Cartesian atau Z-Matrix
• tampilan 3D dari struktur dan mode Normal
• Animasi mode normal.
• 3D rotasi real-time dan terjemahan di bawah kontrol mouse
• Perhitungan parameter Z-matriks
• ukuran visual / jarak layar, sudut dan dihedrals.
• penciptaan otomatis dari Linear Least Motion (LLM) jalur
• 2D dan 3D perhitungan dan tampilan:
• orbital molekul (AO itu, MO itu, atau MOL itu)
• Jumlah Elektron Kepadatan
• perbedaan Density
• Molekuler elektrostatik Potensi (MEPMaps)
• Dasar Generator file input untuk GAMESS
• OpenGL digunakan untuk kualitas tinggi render 3D
• Dukungan untuk simetri molekul
• Menghasilkan simetri atom tergantung
• Menentukan simetri atom unik
• Secara otomatis menentukan daftar grup jalur didukung untuk satu set koordinat.
• Putar koordinat ke dalam orientasi prinsip yang tepat
• operator Tampilan simetri bagi banyak grup jalur
• kualitas output Publikasi (warna atau hitam dan putih) melalui pencetakan langsung atau Copy dan Paste ke aplikasi lain.
• Output dalam berbagai bentuk termasuk Windows bitmap, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, Flash Film dan film QuickTime.

Apa yang baru dalam rilis ini:

Beberapa perangkat tambahan telah dibuat untuk kode display. Pilihan telah ditambahkan ke 3D Pane dari prefernces untuk shading yang halus dengan dan tanpa bayangan.
Ditambahkan dukungan dasar untuk file Mopac.
Pilihan untuk beralih visibilitas ab initio, MM, dan atom EFP ditambahkan.
Peningkatan dukungan untuk Model Inti Potensi.
Ditambahkan kail dalam pembangun masukan untuk program GAMESSQ baru.
Peningkatan file parser PDB.