Serial Cloner

Serial Cloner adalah perangkat lunak biologi molekuler. Ini menyediakan alat dengan antarmuka yang intuitif yang membantu Anda dalam kloning DNA, analisis urutan dan visualisasi. Serial Cloner telah dikembangkan untuk memberikan software biologi molekuler cahaya untuk kedua Macintosh dan Windows pengguna. Serial Cloner membaca dan menulis DNA Strider (tm) file -yang kompatibel dan impor dan ekspor file dalam format FASTA yang universal (serta dalam format pDRAW32). Alat tampilan grafis yang kuat dan antarmuka yang sederhana membantu analisis dan konstruksi tangga (adaptor, PCR, Gateway [tm] kloning) dengan cara yang sangat intuitif. Versi 1.3 sekarang menambahkan cutter virtual, web browser dengan impor instan entri NCBI / EMBL dan peta pembatasan diam bersama-sama dengan perangkat lainnya.

Apa yang baru dalam rilis ini:

• [NEW] Perkiraan titik isoelektrik urutan protein (DNA dan Protein Urutan Window)
• versi [NEW] MacOSX sekarang didistribusikan sebagai aplikasi yang ditandatangani (kompatibilitas Mountain Lion Gatekeeper)
• [TAMBAH] Sebuah pilihan di Preferensi untuk memilih pK tabel nilai yang akan digunakan untuk estimasi pI
• [TAMBAH] Sebuah pilihan di Preferensi untuk menggunakan kode Kodon dari Kodon tabel Penggunaan sebagai kode genetik yang digunakan untuk penjabaran
• [TAMBAH] Sebuah pilihan di jendela Pembatasan Peta hanya menerjemahkan nukleotida yang dalam huruf besar
• [TAMBAH] Sebuah tombol / menu untuk memilih situs tertentu yang akan ditampilkan dalam peta Pembatasan.
• [TAMBAH] Pindai Fitur peptida dalam Urutan Protein
• [TAMBAH] Mewarisi Fitur ketika reverse-menerjemahkan urutan DNA
• [TAMBAH] Sebuah switch cepat antara DNA dan Protein Align jendela
• [TAMBAH] Non diformat salinan urutan Protein (Salin Lebih ... Menu)
• [TAMBAH] Mewarisi Fitur ketika urutan menyalin / Protein Paste
• [TAMBAH] Fitur Display di Protein Align (Align Lokal)
• [TAMBAH] Sebuah tombol aktivasi untuk menyoroti perbedaan dalam protein selaras
• [TAMBAH] Sebuah pintas (S) dengan cepat menampilkan atau Fitur mask (di Fitur tab Urutan Windows)
• [TAMBAH] 'jangkar' dan domain 'Core' dari Primer kini diakui sebagai Fitur di urutan Windows
• [TAMBAH] Sebuah tombol dengan cepat memilih insert linear penuh di 'Membangun Membangun sebuah' jendela
• [TAMBAH] Ditambahkan jalan pintas untuk 'Copy Non Terformat' [COMMAND-SHIFT-K]
• [TAMBAH] Sebuah entri menu untuk pergi ke Serial Cloner Forum
• [TAMBAH] Sebuah entri menu untuk pergi ke Serial Cloner Youtube Channel (tutorial)
• [UPDATED] Sekarang mungkin untuk sepenuhnya mengubah ukuran jendela Urutan
• [UPDATED] situs Absen ditunjukkan pada miring enzim jendela pemilih (Graphic dan Pembatasan Maps)
• [UPDATED] situs unik ditunjukkan dalam huruf tebal di jendela enzim pemilih (Graphic dan Pembatasan Maps)
• [UPDATED] Parsing urutan NCBI (Web Access) untuk mengambil perubahan rekening halaman NCBI.
• [UPDATED] Peningkatan parsing dari urutan mengandung 'X' di urutan nukleotida
• [UPDATED] pintas Berubah dari 'Copy Semua Urutan Untuk Multifasta' ke [COMMAND-SHIFT-J] bukan [COMMAND-SHIFT-K]
• [DIPERBAIKI] Sebuah bug antarmuka Windows-spesifik jendela 'Impor Kodon Bias'
• [DIPERBAIKI] Sebuah bug kadang-kadang mencegah copy yang tepat gambar (peta Grafis, Virtual Cut, shRNA) dalam clipboard (Windows spesifik)
• [DIPERBAIKI] Masalah yang timbul dengan nama RE biasa seperti R1.BceSIV di tertentu enzim "pemilih dari Map Graphic.
• [DIPERBAIKI] Masalah [Gateway Cloning] dengan Fitur indikasi ketika vektor tujuan adalah antisense (arah att2-att1)
• [DIPERBAIKI] Sebuah bug dalam pemilihan AA yang paling banyak digunakan saat menerjemahkan terbalik
• [DIPERBAIKI] Masalah dengan "Pilih Semua" di urutan dan Protein jendela
• [DIPERBAIKI] Masalah tipe file terkait dengan file Cloner Serial (melanggar kompatibilitas dengan Sequencher impor khususnya)
• [DIPERBAIKI] Ligasi: Kadang-kadang tidak perlu diproduksi merosot DNA
• [DIPERBAIKI] Gateway: DNA yang dihasilkan tapi kemudian ketika kemudian disimpan sebagai jenis yang tidak diketahui
• [DIPERBAIKI] PCR:. Jika dilakukan pada "format tidak dikenal" urutan, salah dihasilkan "Protein" jenis
• [DIPERBAIKI] Masalah memperbarui Fitur saat melepas modifikasi
• [DIPERBAIKI] Ketika menyisipkan urutan protein dalam format GenBank (NCBI) jendela urutan protein sekarang benar dibuat.
• [DIPERBAIKI] Masalah dengan BLAST Server NCBI saat menggunakan karakter non-ASCII dalam nama Urutan
• [DIPERBAIKI] Masalah dengan display Fitur setelah scan ketika hanya satu Fitur ditemukan
• [DIPERBAIKI] Masalah langka layar Fitur dalam Membangun Jendela
• [DIPERBAIKI] Sebuah masalah refresh ketika menggunakan ukuran karakter yang berbeda dari 12 pt dalam peta Grafis.
• [DIPERBAIKI] Sebuah bug di jendela Pembatasan peta di mana baris pertama terjemahan asam amino dialihkan dalam mode kodon
• [DIPERBAIKI] Sebuah bug yang terkait mencegah penggunaan enzim yang dipilih sebelumnya di Virtual Cutter Jendela