Melihat protein-protein dan ligan-protein interaksi sebagai grafik (jaringan), di mana biomolekul direpresentasikan sebagai node dan interaksi mereka direpresentasikan sebagai link, adalah pendekatan yang menjanjikan untuk mengintegrasikan hasil eksperimen dari sumber yang berbeda untuk mencapai pemahaman yang sistematis tentang mekanisme molekuler mengemudi fenotip sel. Munculnya jaringan signaling skala besar memberikan kesempatan untuk analisis statistik topologi, sedangkan visualisasi jaringan tersebut merupakan sebuah tantangan. SAVI menerapkan metode standar untuk menghitung clustering, distribusi konektivitas dan deteksi, serta visualisasi, motif jaringan. Selain itu, SAVI menghasilkan sebuah situs web lengkap dari dataset jaringan dalam format teks. SAVI berisi alat yang disebut PathwayGenerator. Alat ini menciptakan peta koneksi sebagai halaman web dari meja besar yang menggambarkan interaksi pensinyalan sel. SAVI juga dapat membuat jaringan dari daftar nama gen / protein
Versi 2.5 mungkin termasuk unspecified updates, perangkat tambahan, atau perbaikan bug
Persyaratan :..
Windows (semua)
Komentar tidak ditemukan