Software screenshot:
Rincian Software:
Versi: 1.5.13 Diperbarui
Tanggal Upload: 26 Apr 16
Pengembang: The CDK Project
Lisensi: Gratis
Popularitas: 196
Kimia Development Kit (juga dikenal sebagai CDK) adalah platform-independen, bebas didistribusikan dan perangkat lunak open source perpustakaan dilaksanakan di Jawa dan dirancang khusus untuk bioinformatika struktural, kimiawi dan kimia komputasi.
Proyek ini terdiri dari berbagai algoritma yang berguna dan struktur data dirancang khusus untuk programmer yang ingin menghemat banyak waktu dan usaha dengan menggunakan kembali kode. Pembangunan Kimia Kit tidak dirancang untuk digunakan oleh pengguna akhir.
Fitur sekilas
Fitur utama termasuk dukungan untuk membaca dan menulis format data kimia, dukungan untuk rendering struktur kimia, dukungan untuk QSAR (Struktur Kuantitatif & ndash; aktivitas Relationship). Deskriptor, serta built-in algoritma untuk mendukung teori graf kimia
Untuk kenyamanan Anda, aplikasi ini didistribusikan sebagai binari pre-built dalam format file JAR. Untuk menggunakannya dalam proyek Anda, cukup download versi stabil terbaru dari Softoware menggunakan link di atas, di mana Anda juga dapat menemukan program & rsquo;. S tarball source
Programmer akan menemukan informasi rinci tentang bagaimana untuk mengkompilasi program dari sumber, bagaimana menjalankan berbagai tes, serta bagaimana menggunakannya dalam program lain dalam file README.txt yang terletak di dalam arsip tar.gz.
Di bawah kap mesin dan didukung OS
Mengambil melihat di bawah kap CDK yang (Kimia Development Kit) perangkat lunak, kita bisa menyebutkan bahwa itu telah seluruhnya ditulis dalam bahasa pemrograman Java.
Saat ini, sepenuhnya kompatibel dengan 32-bit dan 64-bit rasa dari GNU / Linux, Microsoft Windows dan sistem operasi Mac OS X. Namun, harus bekerja pada OS yang didukung oleh Java Runtime Environment (JRE) & nbsp; dan Java Development Kit (JDK) & nbsp; teknologi
Apa yang baru dalam rilis ini:
- biaya formal dari IAtomcontainer ditransfer ke IMolecularFormula
- Fixed bug 2787332 Array obligasi lama dalam perhitungan biaya Gasteiger ditetapkan untuk
- Updated untuk memperbaiki bug 2788357 SMARTSQueryTool sekarang menangkap TokenMgrError di construc yang
- Ditambahkan taglet baru untuk memproses cdk.githash tag dan link yang Javadocs sumber di Git repo
- Updated tag cdk.svnrev untuk cdk.githash tag
- Bug_2787332. tes menambahkan untuk molekul Triclosan (Inchi = 1S / C12H7Cl3O2 / c13-7-1-3-11
- Dihapus usang kode penyaji: baik menggunakan cdk-1.0.x atau JChemPaint-primer
- tes Ditambahkan untuk bug 2786624 dalam tes parser Suite
- link Ditambahkan ke halaman PMD
- Ditambahkan Link ke statistik JUnit
- Ditambahkan daftar kelas di modul, dengan link ke Nightly @ Pele
- Ditambahkan diatur untuk membuat halaman modul HTML
- Ditambahkan diatur untuk membuat halaman modul HTML
Apa yang baru di versi 1.5.10:
- Biaya formal dari IAtomcontainer ditransfer ke IMolecularFormula
- Fixed bug 2787332 Array obligasi lama dalam perhitungan biaya Gasteiger ditetapkan untuk
- Updated untuk memperbaiki bug 2788357 SMARTSQueryTool sekarang menangkap TokenMgrError di construc yang
- Ditambahkan taglet baru untuk memproses cdk.githash tag dan link yang Javadocs sumber di Git repo
- Updated tag cdk.svnrev untuk cdk.githash tag
- Bug_2787332. tes menambahkan untuk molekul Triclosan (Inchi = 1S / C12H7Cl3O2 / c13-7-1-3-11
- Dihapus usang kode penyaji: baik menggunakan cdk-1.0.x atau JChemPaint-primer
- tes Ditambahkan untuk bug 2786624 dalam tes parser Suite
- link Ditambahkan ke halaman PMD
- Ditambahkan Link ke statistik JUnit
- Ditambahkan daftar kelas di modul, dengan link ke Nightly @ Pele
- Ditambahkan diatur untuk membuat halaman modul HTML
- Ditambahkan diatur untuk membuat halaman modul HTML
Apa yang baru di versi 1.2.2:
- link Tetap. Suboptimal, sebagai jalan masih hardcoded ke contoh Nightly tunggal, tapi kami tidak memiliki kerangka XML belum merangkum hal-hal di atas semua nightlies (berjalan
- Updated nomor versi
- tes Ditambahkan untuk memastikan IAtomContainers tidak menyelinap di melalui IMoleculeSet.add (IAtomContainerSet)
- ditimpa addAtomContainer (IAtomContainer, ganda) juga, untuk membuang IllegalArgumentException ketika non-IMolecule dilewatkan
- Sekarang melempar IllegalArgumentException ketika mencoba untuk menyimpan IAtomContainer yang bukan merupakan IMolecule
- Ditambahkan unit test untuk # 2784182
- tes baru dengan reserpin
- taglets Ditambahkan untuk threading keselamatan
- Dengan satu atom atau kurang, kita mendefinisikannya untuk dihubungkan, karena tidak ada partisi yang diperlukan (perbaikan # 2784209, NullPointerException pada IAtomContainer tanpa atom)
- Ditambahkan unit test untuk bug # 2784209 yang saat gagal
- Lebih penghapusan nama paket org.openscience.cdk eksplisit: klausa throws
- Lebih penghapusan nama paket org.openscience.cdk eksplisit
- Lebih penghapusan nama paket org.openscience.cdk eksplisit: untuk org.openscience.cdk.Foo baru () panggilan
- Dihapus org.openscience.cdk.interfaces eksplisit paket nama (perbaikan # 2.783.549)
- Dihapus nama paket eksplisit, mendukung impor, untuk org.openscience.cdk dalam modul datadebug (perbaikan # 2.783.549)
- Dihapus nama paket eksplisit, mendukung impor, untuk org.openscience.cdk dalam modul data (perbaikan # 2.783.549)
- breakout dari pilihan rekursi pada AllRingsFinder
- Ekstraksi dari string rumus unsur biaya.
- Ekstraksi dari string rumus unsur biaya.
- Controller massa saat itu keluar dari kisaran
- Updated untuk cerdas menambahkan H untuk sebuah PLANAR3 N, perbaikan bug 2.781.199
- Ditambahkan uji kasus untuk bug 2781199
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- panggilan untuk CDKException konstruktor dibuat dalam blok catch sekarang termasuk akar pengecualian untuk melestarikan jejak stack
- Ditambahkan tes unit untuk memastikan bidang SD dibaca untuk semua molekul
- berpisah tes
- file baru
- lebih banyak tes untuk cml membaca
- Ditambahkan uji unit untuk # 1848591: salah kerangka Murcko
- cor Tetap, menghapus berlebihan penuh nama paket
- Ditambahkan unit test untuk # 2692107
- ketik Tetap: hilang 's'
Apa yang baru di versi 1.2.1:
- Fixed bug 2.714.283, yang benar melempar pengecualian ketika cincin tidak ditutup dengan benar. Jika cincin tidak tertutup dengan jumlah cincin yang sesuai, InvalidSmilesException dilemparkan. Cocok perilaku Daylight
- Fixed bug 2729120 dan menambahkan unit test
- komentar Updated untuk memperbaiki bug 2.768.643.
- fix Partial untuk bug 2719237. Terbuat getBondOrderSum statis, uji unit menambahkan untuk itu
- Typo: proteinl - & gt; protein
- Terbuat public class, untuk Unbreak menambahkannya ke membangun / *. Javafiles
- SMARTS Sebagian tetap cocok untuk R0. Updated sasaran molekul inisialisasi secara eksplisit menunjukkan atom tidak dalam cincin dan juga diperbarui atom RingMembership untuk melakukan pemeriksaan eksplisit ketika R0 ditentukan. Sebagian perbaikan bug 2587204
- Tetap uji kesamaan meragukan. Sebuah metode swasta sedang memeriksa benda ganda melalui referensi. Bekerja dengan baik ketika mereka nol. Gagal ketika kita perlu membandingkan dengan nilai. Kode diperbarui untuk memperhitungkannya. Ditambahkan unit uji (dan membuat metode dilindungi sehingga dapat diuji)
- metode pengujian Ditambahkan penjelasan. Melengkapi cakupan untuk modul Data
- ChiIndexUtils Refactored untuk membuatnya paket pribadi. Membersihkan API publik, karena hanya digunakan oleh kode deskriptor chi. Updated semua tergantung kelas. kode uji pindah (yang perlu diisi!) serta
- Kode pembersihan ChiIndexUtils. Dikonversi ke 1,5 idiom
- Clean up dari PathTools dan menambahkan metode pengujian penjelasan, sehingga inti yang benar-benar tertutup
- Tetap sebelumnya berkomitmen untuk mengedit garis cdk.keyword, bukan garis cdk.module
- Kata kunci yang lebih konsisten digunakan
- Ditambahkan tes untuk memastikan bahwa benda Integer dibandingkan dengan nilai daripada referensi
- Ditambahkan kasus uji untuk memeriksa bahwa diffs kontainer atom yang benar ketika menggunakan benda deserialized
- Tetap IntegerDifference sehingga benar-benar memeriksa nilai integer daripada referensi dari objek Integer. Perbaikan masalah dimana objek serial ke disk dan kemudian deserialized tidak cocok dengan objek asli (yaitu, non kosong diff string)
- Terapan Patch # 2675819 (Stefan Kuhn): patch untuk menambah removeReaction untuk reactionSet
- Gunakan antarmuka bukan implementasi
- Dihapus impor yang tidak terpakai
- Gunakan IAtomContainer bukan IMolecule, sebagai pencocokan sebenarnya menggunakan IAtomContainers sudah (perbaikan # 2.686.249)
- Tetap ClassCastException (perbaikan # 2.685.134)
- Ditambahkan sumber attrib untuk memperbaiki membangun Ubuntu .deb
- Tetap Bantuan membangun sistem: menggunakan botol Doclet di develjar /; diperbarui untuk folder src baru src / main; dihapus penggunaan sangat usang dari rt.jar
- libdepends Dihapus termasuk untuk uji-ioformats, yang tidak benar-benar memiliki libdepends
- Updated sehingga jika atom target yang tidak memiliki simbol (seperti atom semu) pertandingan mengembalikan false (daripada NPE)
- penanganan Tetap #N SMARTS querys
- Ditambahkan uji kasus untuk bug 2686473
- Ditambahkan catatan pada 1.7.1 Ant diperlukan
- Tetap sumber NPE: 'null == 2' menyebabkan pengecualian, jadi tes pertama bagi nullness
- Tetap pemberitahuan hak cipta untuk tahun 2009
- Tetap duplikat penyimpanan tata letak template, yang hanya termasuk dalam modul sdg, tidak tambahan modul terlalu
- Merge cabang 'local1.2' dari ../../ git-svn / cdk
Apa yang baru di versi 1.2.0:
- Perbaikan beberapa SMARTS parsing masalah, penggunaan dua simbol-surat dan IPseudoAtom di fingerprinter, dan menambahkan 4 definisi jenis atom baru, untuk yodium dan sulfur.
Apa yang baru di versi 1.1.5:.
- Kebanyakan bug fixes
Apa yang baru di versi 1.1.4:.
- perbaikan bug Sebagian kecil
Apa yang baru di versi 1.1.1:
- perbaikan bug Sebagian kecil dan kode umum membersihkan.
Apa yang baru di versi 1.1.0:.
- Banyak, banyak perubahan
Persyaratan :
- Java 2 Standard Edition Runtime Environment
Komentar tidak ditemukan