PANAMA adalah model probabilistik baru untuk menghitung faktor-faktor dalam studi eQTL, ditulis dengan Python.
Faktor pembaur tersembunyi, seperti kovariat tidak teramati atau gangguan lingkungan halus diketahui dapat membuat asosiasi palsu palsu atau masker sinyal asosiasi nyata genetik. Berbeda dengan metode sebelumnya, PANAMA belajar faktor tersembunyi bersama-sama dengan efek regulator genetik terkemuka. Akibatnya, model baru ini dapat lebih akurat membedakan sinyal hubungan genetik benar dari variasi pengganggu.
N. Fusi, O. Stegle dan ND Lawrence, "pemodelan Bersama faktor pembaur dan regulator genetik terkemuka memberikan akurasi meningkat dalam genomik genetik studi", PLoS Computational Biology 2012
Informasi lebih di http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html
Requirements:
- Python
Komentar tidak ditemukan