Open Babel merupakan open source, kolaboratif, perangkat lunak perpustakaan gratis dan multiplatform yang telah dirancang untuk bertindak sebagai kotak peralatan kimia khusus direkayasa untuk mengenali berbagai bahasa data kimia. Hal ini hanya dijuluki & ldquo; The Open Kimia Toolkit & rdquo;. Fitur pada glanceWith Terbuka Babel, pengguna akan dapat mencari, menganalisis, mengubah, dan menyimpan data dari kimia, pemodelan molekul, biokimia, serta bidang terkait lainnya. Mendukung berbagai format file kimia yang umum, termasuk Mol2, SDF / MOL, PDB, XYZ, SMILES, dan CML.
Selain itu, Open Babel menyediakan dukungan toolkit, MIME kimia berfitur programmer penuh, SMARTS matcher, atom fleksibel / typer obligasi, hidrogen penghapusan dan penambahan, bitvector kelas, matriks dan vektor transformasi, serta tes suite.Under molekul tenda dan didukung operasi systemsOpen Babel seluruhnya ditulis dalam bahasa pemrograman C ++. Ini & rsquo; s software cross-platform yang benar yang mendukung GNU / Linux, BSD, Solaris, SGI, Microsoft Windows dan sistem operasi Mac OS X. 32-bit dan 64-bit komputer secara resmi didukung pada saat menulis this.Getting dimulai dengan Open BabelFirst semua, kami sangat menyarankan Anda untuk menginstal Terbuka Babel dengan menggunakan paket binary pre-built dari repositori perangkat lunak default Anda distribusi Linux. Jika sistem GNU / Linux Anda doesn & rsquo; t memiliki perangkat lunak Open Babel di repo nya, maka Anda & rsquo; ll harus mengkompilasi dan instalasi aplikasi yang menggunakan sumber universal arsip disediakan di Softoware.
Download tarball (tar.gz arsip), ekstrak di lokasi pilihan Anda, buka terminal emulator, arahkan ke folder diekstraksi dan menjalankan & ldquo;. Cmake & rdquo; perintah (tanpa tanda kutip) untuk mengkonfigurasi proyek. Kemudian, Anda harus menjalankan & ldquo; membuat & rdquo; perintah, tanpa tanda kutip, tentu saja, untuk kompilasi. Pastikan bahwa alat CMake di diinstal pada sistem operasi Anda sebelum instruksi di atas
Apa yang baru dalam rilis ini:.
- Rilis ini merupakan bug-fix-rilis utama dan harus upgrade stabil, sangat disarankan untuk semua pengguna Open Babel. Banyak bug dan perangkat tambahan telah ditambahkan pada tahun lalu sejak rilis 2.3.0.
Apa yang baru dalam versi 2.2.2:
- Rilis ini merupakan rilis bug-fix utama dan adalah upgrade yang stabil, sangat disarankan untuk semua pengguna Open Babel. Meskipun ada mungkin tidak banyak fitur baru, banyak crash dan bug lain telah diperbaiki sejak 2.2.1.
- Upgrade ke rilis Inchi 1.02 baru untuk menghasilkan standar Inchi dan InChIKey output.
- Tetap banyak kesalahan stereokimia ketika membaca / menulis SMILES. Ini adalah bagian dari proyek yang lebih besar yang akan selesai dalam rilis 2.3.
- kompilasi tetap dan instalasi di Cygwin dan MinGW platform .
- Secara signifikan meningkatkan aromatisitas dan Kekulé tugas obligasi.
- Peningkatan 2D - & gt; 3D mengkoordinasikan generasi
- Peningkatan koordinasi generasi menggunakan operasi baris perintah --gen3d
- Peningkatan kinerja untuk mengkoordinasikan generasi.
- New --fillUC operasi baris perintah untuk babel.
- Perbaikan untuk bergantung pH-penambahan hidrogen.
- Ditambahkan dukungan untuk membaca data getaran dari Molden, Molpro, dan NWChem file output.
- Diperbarui jari-jari atom dari perhitungan teoritis baru-baru ini.
- Fixed bug ketika membaca gzip-terkompresi Mol2 atau XML file .
- Tutup file setelah kesalahan. Perbaikan bug dengan Pybel mana file akan tetap terbuka.
- Banyak perbaikan bug dan perbaikan lebih fitur kecil. == New Format File == Impor & Ekspor:
- Molpro input dan output .
- VASP koordinat file (CONTCAR dan POSCAR).
Apa yang baru dalam versi 2.2.1:
- Peningkatan antarmuka scripting, termasuk Python 3 dukungan dan ditingkatkan Java dan C # dukungan.
- Ditambahkan dukungan untuk MACCS sidik jari. Berkat proyek RDKit.
- Banyak perbaikan dan penyempurnaan kode medan kekuatan. Secara khusus, pelaksanaan UFF medan kekuatan harus menangani lebih banyak molekul.
- Peningkatan 3D koordinat generasi, terutama dengan fragmen cincin. Anda dapat memberikan ini mencoba dengan utilitas obgen.
- Fixed berbagai kesalahan impor PDB dengan jenis atom.
- Ditambahkan dukungan untuk membaca tuduhan dan jari-jari dari format file PQR.
- Ditambahkan dukungan untuk membaca dan menulis unit sel dalam format PDB.
- New & quot; keluaran & quot; format file untuk mengambil generik & quot; & quot ;, .out & quot; & quot ;, .log dan & quot; dat & quot; file dan membaca dengan jenis file yang sesuai berdasarkan isi. Saat ini bekerja sangat baik untuk paket kimia kuantum.
- Ditambahkan peningkatan penanganan kesalahan dan pelaporan ketika tidak dapat memuat format file.
- Peningkatan CIF dukungan format file.
- Banyak, banyak, banyak perbaikan bug tambahan dan perangkat tambahan kecil.
Komentar tidak ditemukan