MISO (Campuran isoform) adalah kerangka probabilistik ditulis dengan Python yang quantitates tingkat ekspresi & nbsp; gen alternatif disambung dari data RNA-Seq, dan mengidentifikasi isoform diatur berbeda atau ekson seluruh sampel.
Dengan pemodelan proses generatif dengan yang berbunyi dihasilkan dari isoform di RNA-Seq, model MISO menggunakan inferensi Bayesian untuk menghitung probabilitas bahwa dibaca berasal dari isoform tertentu.
MISO menggunakan penugasan disimpulkan dari membaca untuk isoform menduga jumlah kelimpahan set mendasari isoform mRNA alternatif. Interval kepercayaan atas perkiraan dapat diperoleh, yang mengukur keandalan perkiraan.
Silakan lihat http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ untuk panduan miso dan dokumentasi
Persyaratan :.
- Python
Komentar tidak ditemukan