InterMine

InterMine menyediakan akses rutinitas untuk datawarehouses didukung oleh teknologi InterMine.
InterMine adalah open source sistem data warehouse yang kuat. Menggunakan InterMine, Anda dapat membuat database data biologis diakses oleh alat query web canggih. Parsers disediakan untuk mengintegrasikan data dari beberapa format biologi umum dan ada kerangka kerja untuk menambahkan data Anda sendiri. InterMine termasuk menarik, user-friendly antarmuka web yang bekerja 'di luar kotak' dan dapat dengan mudah disesuaikan untuk kebutuhan spesifik Anda.
Semua kode InterMine tersedia secara bebas di bawah lisensi LGPL

Apa yang baru dalam rilis ini:.

• Menghubungkan ke InterMine:
• Ada beberapa cara baru untuk menghubungkan ke Tambang Anda. Lihat Link untuk rincian.
• layanan Web format JSON:
• Ada beberapa format hasil jejaring baru. Bergabung jsonobjects yang muncul pada 0,95, kita sekarang memiliki format JSON untuk hampir segala sesuatu yang lain:
• Hasil:
• jsonrows - representasi tabular data dengan meta-data tambahan
• & quot; jsontable & quot; . - Format kontainer untuk membangun template tertanam (lihat: imbedding tutorial)
• & quot; count & quot; dan & quot; jsoncount & quot; - Format untuk hanya menerima menghitung dari query
• WebService meta-data (Model dan Template):
• & quot; json & quot; - Versi mudah parsable dari model data dan daftar template yang tersedia
• Otentikasi Sekarang Bekerja di Perl WebService Client:
• Pengguna klien Perl WebService sekarang memiliki akses program ke daftar mereka dan template pribadi. Cukup memberikan rincian login Anda ke klien untuk mengakses akun Anda (rincian Anda ditransmisikan dalam format terenkripsi). Fitur ini akan bekerja dengan semua tambang dengan web services, bukan hanya orang-orang di 0,96 dan di atas.
• Hasil Obyek dengan WebService Klien:
• The Perl dan Jawa klien dapat mendapatkan hasil kembali sebagai objek (JSON Objects, atau dalam Perl, meningkat hingga hasil benda penuh). Ini menyederhanakan beberapa masalah pengolahan data yang kompleks, dan berurusan dengan luar bergabung dan koleksi.
• Tabel Tertanam:
• Anda sekarang dapat native menanamkan tabel data dari tambang apapun dengan jejaring pendukung ke laman web dengan JavaScript dan CSS. Melihat imbedding tutorial untuk demonstrasi dan pengenalan teknik ini. Pastikan untuk bermain-main dengan perpustakaan JavaScript baru tersedia di http://www.intermine.org/lib/imbedding.
• Registry:
• Kami telah meluncurkan layanan pendaftaran pusat untuk InterMine implementasi. Hal ini tidak hanya akan berfungsi sebagai & quot; Kuning-halaman & quot ;, memungkinkan pengunjung untuk menemukan data sumber baru, dan memfasilitasi interoperation antara tambang sendiri, tetapi juga mendukung web services dengan menyediakan registry url jejaring dan versi. Kunjungi registri di http://www.intermine.org/registry, dan untuk membantu dalam mendaftar tambang sendiri, kunjungi RegisteringYourMine.
• Tautan Redirect:
• Anda dapat menambahkan properti untuk memiliki link di halaman hasil redirect ke URL. Lihat LinkRedirects untuk informasi lebih lanjut.

Konten
• Home page:
• Halaman rumah untuk InterMine sekarang dapat dikonfigurasi untuk menampilkan informasi yang berbeda berdasarkan pada apakah atau tidak pengguna baru. Lihat HomepageConfig untuk petunjuk tentang cara mengkonfigurasi perilaku ini.
• Tag baru:
• Kami telah menambahkan tag baru: im: admin. Jika Anda tag template dengan im: admin, tidak akan muncul dalam webapp Anda. Hal ini berguna untuk menyembunyikan template yang dibutuhkan oleh web services InterMine itu dari pengguna Anda. Lihat Tagging untuk daftar semua tag yang tersedia.
• Daftar Upload:


• proses upload daftar telah diperbaiki.
• Perubahan lain:
• UPDATE - lebih ketat koreksi pengujian hipotesis beberapa di widget pengayaan. & Quot; Jumlah tes & quot; sekarang jumlah istilah yang terkait dengan daftar referensi.
• UPDATE - lebih bermanfaat pilihan filter pada widget pengayaan
• NEW - Holm-Bonferroni pilihan ditambahkan ke widget pengayaan
• UPDATE - baru & quot; menghapus & quot; tombol pada halaman daftar
• UPDATE - interaksi Displayer dimuat melalui AJAX sehingga melaporkan beban halaman lebih cepat
• FIX - & quot; nilai & quot; menampilkan gambar dengan benar pada hasil pencarian
• UPDATE - QueryBuilder lebih interaktif, memilih item dalam daftar akan membawa Anda kembali ke item asli setelah refresh halaman / isi ulang
• UPDATE - Link ditambahkan ke ringkasan kolom dalam hasil query, pembuatan lebih mudah untuk melihat nilai-nilai yang berbeda
• FIX - bug masuk mengenai dicampur username kasus
• FIX - widget bug ketika melihat setelah mengekspor Data widget
• NEW - query Template yang diperintahkan oleh popularitas, kecuali Anda login, dalam hal ini mereka yang diperintahkan oleh tanggal setiap query adalah run terakhir
• FIX - Data tidak terulang dalam & quot; quot aneka &; pada halaman laporan
• FIX - template ditampilkan dengan benar pada halaman laporan bahkan untuk subclass
• FIX - template dengan benar rendering pada halaman aspek
• UPDATE - update BioGRID converter untuk menangani perubahan file data terbaru
• FIX - berbagai & quot; emas & quot; Tema CSS dan gambar ditingkatkan dan diperbarui
• FIX - masalah keamanan benang dibahas dalam template pelacakan
• UPDATE - tabel widget dapat mengelompokkan oleh atribut serta kelas

Persyaratan :

• Python