iNA

INA (intrinsik Kebisingan Analyzer) adalah software grafis open source yang ditulis dalam Qt dan dirancang untuk bertindak sebagai utilitas analitik, mengukur fluktuasi dalam jaringan biokimia.
Intrinsik Kebisingan Analyzer mampu komputasi Linear Kebisingan Approximation (LNA), serta pendekatan yang lebih akurat otomatis diperoleh dari perluasan ukuran sistem file SBML (Sistem Biologi Markup Language).
Yang ditulis di Qt, INA adalah alat cross-platform yang mendukung Linux, Mac OS & nbsp; sistem operasi X dan Windows

Apa yang baru dalam rilis ini:.

• Parameter scan (sejak 0,4) - Mendapatkan ukuran statistik seperti koefisien variasi, Fano faktor serta sarana dan varians konsentrasi dari kebisingan pendekatan linier, tingkat tinggi koreksi atau stokastik waktu rata-rata- simulasi.
• jumlah dilestarikan -. Menganalisis hukum konservasi model Anda di Ina
• Editor Plot - Sebuah editor plot baru untuk visualisasi kualitas tinggi memungkinkan untuk menyesuaikan dan mengedit semua plot yang ada di INA. Anda dapat menambah atau menghapus grafik dari data simulasi tanpa hazzle dari replotting.
• dukungan OpenMP untuk MacOS X - Membuat menggunakan penuh sumber daya dan melakukan analisis dan simulasi di beberapa core secara otomatis dan secara paralel
.

Apa yang baru dalam versi 0.4.1:

• parameter SSA memindai
• Lebih efisien SSE parameter scan menggunakan bytecode interpreter atau LLVM
• Drag & drop model ke panel samping untuk impor
• Mengaktifkan Plot Disesuaikan untuk Windows menggunakan bytecode interpreter
• Izinkan pesan log yang akan disimpan ke file atau disalin ke clipboard
• Tingkat penyaring untuk pesan log
• ambang batas yang lebih rendah untuk autocompletion
• Pemberitahuan jika identifier tidak dapat diubah
• Pemberitahuan jika ungkapan tidak bisa diurai
• Memungkinkan untuk memindahkan parameter lokal ke lingkup global
• Sesuaikan Makefile untuk kompilasi dengan LLVM 3.2
• Izinkan TeX dalam label Plot
• judul petak Center pada sumbu bukan sosok
• Fix: Segmentation fault ketika memperluas reaksi reversibel
• Fix: ekspresi Ekspor menggunakan exp () ke SBML
• Fix: analisis tunak, konsentrasi nol salah dinyatakan stabil
• Fix: Warna label sumbu tick
• Fix: Ukuran font di SVG ekspor
• Fix: Hapus Fano plot untuk parameter volume yang memindai
• Fix: Beberapa kebocoran memori
• Fix: Penanganan parser Salah operator asosiatif
• Fix: Serialisasi bilangan bulat besar abs () & # x3e; 1E6
• Fix: Update kinetik pandangan hukum / Kimia eq setelah memperbarui reaksi
• Fix: Penanganan Exception untuk volume 0
• Fix: Izinkan simbol TeX dikenal di Plot Disesuaikan
• Fix: Exception untuk model analisis kosong
• Fix: view reaksi Update jika nama parameter atau pengenal diubah
• Fix: Layout TeX superscript
• Fix: Fungsi panggilan ekspresi penulis
• Fix: keselarasan vertikal garis dan label dalam legenda petak
• Fix: Unit untuk parameter reaksi
• Fix: Disesuaikan Plot hilang legenda petak
• Fix: Penanganan nama file unicode
• Fix: Ekspor unit zat SBML
• Fix: Parsing unit substansi dalam SBMLsh
• Fix:. Latar Belakang ekspresi diberikan
• Fix: Disesuaikan kursor mouse hoovering untuk model unit untuk menunjukkan bahwa mereka dapat diedit. Juga menambahkan tooltip.
• Fix: Judul Jendela editor SBML-SH
• Fix: Warna dalam tabel steady state (menjadi non-dipilih)

Persyaratan :

• CMake
• Qt