BioRuby

BioRuby menyediakan lingkungan yang terintegrasi untuk Bioinformatika (Biologi ilmu Informasi).
Objek bahasa scripting berorientasi Ruby memiliki banyak fitur yang cocok untuk bioinformatika penelitian, misalnya, sintaks yang jelas untuk mengekspresikan objek yang kompleks, ekspresi reguler untuk penanganan teks sekuat Perl & rsquo; s, berbagai perpustakaan termasuk layanan web dll
Sebagai sintaks Ruby sederhana dan sangat bersih, kami percaya bahwa adalah mudah untuk belajar bagi pemula, mudah digunakan untuk ahli biologi, dan juga cukup kuat untuk pengembang perangkat lunak.
Dalam BioRuby, pengembang dapat mengambil entri database biologis dari flat file, server web internet dan database relasional lokal.
Entri database ini bisa diurai untuk mengekstrak informasi yang Anda butuhkan. Urutan biologis dapat diobati dengan metode memuaskan dari Ruby & rsquo; s kelas String dan dengan ekspresi reguler.
Perpustakaan dapat diintegrasikan dengan alat-alat seperti ledakan, Fasta, Hmmer dan banyak paket perangkat lunak lain untuk analisis biologis.
 BioRuby mendukung format database biologis besar dan menyediakan banyak cara untuk mengakses mereka melalui flatfile pengindeksan, SQL, layanan web dll Berbagai layanan web termasuk kegg API dapat dengan mudah dimanfaatkan oleh BioRuby.

Fitur :

• BioRuby shell
• API
• Dokumentasi

Persyaratan :

• Ruby 1.8.7 atau lebih tinggi