Bibliosphere Analysis Kit

BiblioSphere menawarkan kombinasi unik dari sastra-pertambangan dan analisis jalur untuk ahli biologi molekuler tertarik regulasi gen dan jaringan biologis.
 BiblioSphere Pathway Edition menggunakan database yang komprehensif hubungan model individual antara gen, protein, kompleks, sel-sel dan jaringan bersama-sama dengan teknik pertambangan up-to-date teks untuk ekstraksi pengetahuan otomatis untuk memungkinkan Anda untuk menghubungkan data ke jaringan biologis dalam konteks biologis yang berbeda.
 Gunakan BiblioSphere untuk

• memperluas jaringan biologis di luar informasi jalur kanonik (peraturan & metabolisme)
• menggabungkan hasil throughput yang tinggi Anda dengan pengetahuan biologi dan urutan analisis berbasis
• melakukan context Analisis jalur regulasi sensitif
• menghasilkan untuk eksperimen varian jalur
• jalur link mekanisme penyakit & gen
• melakukan canggih rancangan percobaan

Apa yang baru dalam rilis ini:

Baru dan Peningkatan Sumber Data

• Genomatix Ahli curated Gene-Gene Hubungan:
   Genomatix telah terintegrasi pengetahuan dasar eksklusif ahli data yang dikuratori pada regulasi gen ke BiblioSphere. Sumber data yang unik ini menambah semantik hubungan gen-gen ke jaringan gen BiblioSphere dihasilkan secara dinamis, memberikan informasi seperti "Gene A mengaktifkan transkripsi gen B" atau "Gene A secara fisik berinteraksi dengan gen B".
  
• Signal Persiapan Transduction:
   Bagian dari Gene Ontologi relevan dengan transduksi sinyal serta data yang dikumpulkan dari literatur telah digabungkan untuk memungkinkan identifikasi jalur kanonik terkait dengan jaringan terfokus.
  
• Metabolik Asosiasi Pathway:
   Asosiasi jalur metabolisme telah terintegrasi untuk memungkinkan identifikasi peristiwa metabolisme yang relevan untuk mengatur Anda gen.
  

• Pathway View dengan ahli curated hubungan gen-gen
   Kelompok gen yang dikompilasi ke mudah dipahami grafik jaringan dinamis menggabungkan tangan curated hubungan gen-gen dengan data yang berasal dari ekstraksi pengetahuan otomatis. Jaringan dapat disesuaikan dengan filter dan terfokus dengan cara gen yang berpusat untuk melakukan analisis jalur terpendek.
  
• Seluler Lokalisasi View
   Berdasarkan GO Penjelasan gen ditugaskan ke lokasi subselular dan divisualisasikan sebagai tata letak sel diagrammed, memungkinkan Anda untuk mengidentifikasi daerah subselular dan kompartemen relevan dengan set gen Anda.
  

• Manajemen Proyek: Mengelola analisis Anda dengan mengorganisir mereka ke dalam folder proyek. Cepat mengakses hasil sebelumnya dengan beberapa klik mouse atau menambahkan pencarian baru untuk proyek-proyek yang ada.
  

• Berbagai perangkat tambahan kecil dan perbaikan bug

Persyaratan :

• Mac OS X 10.2 atau lebih tinggi
• Java 1.4.1 (update 1 dianjurkan)
• koneksi ke internet
• akun evaluasi Genomatix (gratis)