Gabedit

Gabedit adalah Graphical User Interface untuk Gaussian, Molcas, Molpro dan MPQC paket kimia komputasi.
 
 Gabedit termasuk fasilitas grafis untuk menghasilkan kata kunci dan pilihan, spesifikasi molekul dan ada bagian masukan bahkan untuk jenis perhitungan yang paling canggih Gabedit mencakup Builder Molekul canggih.
 
 Anda dapat menggunakannya untuk cepat sketsa dalam molekul dan memeriksa mereka dalam tiga dimensi. Anda dapat membangun molekul dengan atom, cincin, kelompok, asam amino dan nukleosida. Anda juga dapat membaca geometri dari sebuah file. Kebanyakan format file molekul besar yang didukung.
 
 Gabedit termasuk Gaussian, Molcas, Molpro dan MPQC Perhitungan Jendela Setup yang memungkinkan Anda untuk mengatur Gaussian, Molcas, Molpro dan MPQC pekerjaan dengan cara yang sederhana dan mudah.
 
 Gabedit termasuk editor teks untuk mengedit Molcas, Molpro, Gaussian dan MPQC file input.
 
 Gabedit grafis dapat menampilkan berbagai Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC dan (sebagian) hasil perhitungan ADF, termasuk yang berikut:
 
 ย ท orbital molekul.
 ย ท permukaan dari kerapatan elektron, potensial elektrostatik, kepadatan perisai NMR, dan properti lainnya.
 ย ท Permukaan dapat ditampilkan dalam mode jala padat, tembus dan kawat.
 ย ท Permukaan dapat diwarnai oleh properti terpisah.
 ย ท Kontur (colorcoded).
 ย ท Pesawat (colorcoded).
 ย ท Dipole
 ย ท sumbu XYZ dan sumbu utama dari molekul.
 ย ท Animasi mode yang normal sesuai dengan frekuensi getaran.
 ย ท Animasi rotasi geometri, permukaan, dipol, xyz dan sumbu utama dari molekul.
 ย ท Animasi kontur.
 ย ท Animasi pesawat colorcoded.
 
 Gabedit dapat menampilkan IR dan Raman dihitung spektrum. Gabedit dapat menghasilkan file povray untuk geometri (atom + obligasi, termasuk obligasi hidrogen), permukaan (termasuk permukaan colorcoded), kontur, pesawat colorcoded.
 
 Gabedit dapat menyimpan gambar di PPM, BMP, (JPEG) dan format PS. Gabedit dapat menghasilkan otomatis serangkaian gambar untuk animasi (getaran, konvergensi geometri, rotasi, kontur, pesawat colorcoded)

Apa yang baru dalam rilis ini:

< li> Minor bug telah diperbaiki.
• NWChem sekarang didukung.
• Permainan Windows asli sekarang didukung.

Apa yang baru di versi 2.3.5:.

• Minor bug yang tetap
• Atom bisa diperbaiki selama simulasi dinamika molekul.
• Migrasi dari Kairo ke OpenGL untuk menggambar jendela geometri.
• Migrasi dari gtkglarea ke GtkGLExt
.
• Paralelisasi menggunakan OpenMP.

Apa yang baru di versi 2.3.0:.

• Minor bug yang tetap
• Pengguna dapat membaca orbital, geometri dan mode yang normal dari file Gaussian fchk.
• Satu dapat membaca orbital dari format file aux Mopac baru (termasuk format terkompresi).
• Beberapa pilihan baru di XYPlot dan ContoursPlot jendela (teks insert, garis, panah, gambar, tema baru ...).
• Panjang obligasi bisa diperbaiki selama simulasi MD.
• optimasi parsial sekarang mungkin dengan potensi MM.
• Pelaksanaan alat untuk memprediksi massa dan jumlah isotop untuk molekul tertentu. Pelaksanaan alat untuk menghitung kepekaan elektrofilik, nukleofilik dan radikal untuk molekul.

Apa yang baru di versi 2.2.0:

• Minor bug yang tetap
• Semua perubahan geometrik dapat dibatalkan dan diulang menggunakan Undo dan Redo (u / U atau Ctrl z / Ctrl y)
• Pengguna memiliki kontrol penuh atas obligasi ditampilkan dalam gambar.
• gambar atom molekul dengan atom telah disederhanakan.
• gambar fragmen molekul oleh fragmen telah disederhanakan.
• Gabedit baca konektivitas dari gabedit, hin, pdb, mol2 dan file mol.
• Pengguna dapat mengatur nilai jarak, sudut ikatan dan sudut dihedral.
• Sebuah dinamika molekul pencarian konformasi diimplementasikan menggunakan potensi MM (Amber 99).
• Sebuah dinamika molekul pencarian konformasi diimplementasikan menggunakan metode Semi-empiris (dari Open Mopac atau PCGamess).
• Migrasi dari fungsi gambar GDK ke Kairo:. Cross-perangkat Rendering untuk Vector Graphics
• Kairo sekarang digunakan untuk widget XYplot gabedit (digunakan oleh gabedit untuk spektrum imbang).
• Kairo sekarang digunakan untuk geometri menggambar jendela.
• Geometry dapat diekspor di eps, ps, pdf atau file yang svg.
• Kurva jendela XYplot dapat diekspor di eps, ps, pdf atau file yang svg.
• alat baru untuk menghitung jarak antara 2 titik di jendela XYPlot. & Quot; Control + tombol pergeseran & quot; dapat digunakan untuk melakukan zoom pada jendela XYPlot.
• Versi baru dari PCGamess (kunang-kunang) sekarang didukung

Apa yang baru dalam versi 2.1.13:

• Minor bug yang fixe
• Sebuah dinamika molekul pencarian konformasi diimplementasikan menggunakan potensi MM (Amber 99).
• Sebuah dinamika molekul pencarian konformasi diimplementasikan menggunakan potensi Semi-empiris (menggunakan MOPAC atau PCGAMESS).
• Satu dapat mengoptimalkan geometri interaktif menggunakan metode MOPAC atau PCGamess semi-empiris, dari Draw Geometri jendela
• Migrasi dari fungsi gambar GDK ke Kairo: Cross-perangkat Rendering untuk Vector Graphics. Kairo sekarang digunakan untuk widget XYplot gabedit (digunakan oleh gabedit untuk spektrum imbang). Kairo sekarang digunakan untuk geometri menggambar jendela.
• Geometry dapat diekspor di eps, ps, pdf atau file yang svg. Kurva jendela XYplot dapat diekspor di eps, ps, pdf atau file yang svg.
• alat baru untuk menghitung jarak antara 2 titik di jendela XYPlot. & Quot; Control + kiri tombol & quot; dapat digunakan untuk melakukan zoom pada jendela XYPlot.
• Versi baru dari PC Gamess / Firefly sekarang didukung

Persyaratan :

• gtk +