Swiss-PdbViewer (alias DeepView) adalah sebuah aplikasi yang menyediakan antarmuka user friendly memungkinkan untuk menganalisis beberapa protein pada waktu yang sama. Protein dapat ditumpangkan dalam rangka untuk menyimpulkan keberpihakan struktural dan membandingkan situs aktif mereka atau bagian lain yang relevan. Mutasi asam amino, H-obligasi, sudut dan jarak antara atom mudah diperoleh berkat antarmuka grafis dan menu yang intuitif.
Swiss-PdbViewer (alias DeepView) telah dikembangkan sejak tahun 1994 oleh Nicolas Guex. Swiss-PdbViewer terkait erat dengan SWISS-MODEL, server pemodelan homologi otomatis dikembangkan dalam Swiss Institute of Bioinformatika (SIB) di Struktur Bioinformatika Group di Biozentrum di Basel.
Bekerja dengan dua program ini sangat mengurangi jumlah pekerjaan yang diperlukan untuk menghasilkan model, karena mungkin untuk benang urutan utama protein ke template 3D dan mendapatkan umpan balik langsung dari seberapa baik protein berulir akan diterima oleh struktur referensi sebelum mengajukan permohonan untuk membangun loop hilang dan memperbaiki kemasan Sidechain.
Swiss-PdbViewer juga dapat membaca peta kerapatan elektron, dan menyediakan berbagai alat untuk membangun ke kepadatan. Selain itu, berbagai alat pemodelan adalah file yang terintegrasi dan perintah paket minimisasi energi populer dapat dihasilkan.
Akhirnya, sebagai bonus khusus, POV-Ray adegan dapat dihasilkan dari tampilan saat ini untuk membuat gambar berkualitas ray-ditelusuri menakjubkan.
Apa yang baru dalam rilis ini:
- The Timin C6 atom sekarang benar dimuat
- Tetap POV-Ray keluaran lingkaran tak berujung pada versi PC
- sesekali kecelakaan saat menyimpan file PDB (seperti 2i37) pada PC telah diperbaiki
- Diperbarui alamat Uppsala Elektron Density Peta Server
Komentar tidak ditemukan