Staden Paket adalah seperangkat dikembangkan sepenuhnya perakitan urutan DNA (Gap4), editing dan alat analisis (spin) untuk Unix, Linux, MacOSX dan MS Windows.Di depan Gap4 ada beberapa minor bergabung terkaitperbaikan dalam bagaimana skor bergabung di...
Proyek STEME mulai hidup sebagai pendekatan dengan algoritma harapan-Maximisation untuk jenis model yang digunakan dalam motif pencari seperti MEME.STEME & rsquo; s EM pendekatan menjalankan urutan besarnya lebih cepat dari pelaksanaan MEME untuk...
LANGKAH adalah paket untuk simulasi stokastik yang tepat dari sistem reaksi-difusi dalam geometri 3D sewenang-wenang kompleks. Algoritma simulasi inti kami adalah implementasi Gillespie SSA, diperluas untuk menangani difusi molekul atas unsur-unsur mesh...
Syntainia adalah aplikasi inovatif untuk visualisasi beberapa genom & nbsp;. Ini menyajikan antarmuka pengguna yang sederhana dan intuitif untuk melihat dan memanipulasi hubungan antara kelompok gen. Dengan visualisasi gen yang lebih jelas, lebih mudah...
SyntenyMiner adalah aplikasi untuk memvisualisasikan dan menginterogasi perbandingan antara beberapa urutan genom lengkap. Antarmuka memberikan pandangan dilayari pertandingan ke urutan genom referensi. Urutan pertandingan antara kromosom dari genom yang...
tapir adalah alat Python yang berisi program untuk memperkirakan dan merencanakan informativeness filogenetik untuk dataset besar. Mengutip tapir Bila menggunakan tapir, silakan mengutip:- Faircloth SM, Chang J, Alfaro ME: tapir memungkinkan analisis...
tigreBrowser adalah ekspresi gen Model Browser untuk hasil dari paket R tigre (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Instalasi: tigreBrowser membutuhkan Python versi> = 2.5. tigreBrowser dapat diinstal dengan perintah...
TRMiner adalah utilitas Python yang bertujuan kurator data ilmiah & nbsp;. Hal ini memungkinkan untuk cepat memangkas koleksi besar publikasi ilmiah untuk kalimat yang relevan untuk tujuan pertambangan yang diberikan.Hal ini dicapai dalam dua langkah....
proyek VULCAN menyediakan komputasi analisis dinamika fluida.VULCAN (kental Upwind Algoritma untuk Analisis Kompleks aliran) menawarkan dinamika fluida komputasi untuk kecepatan subsonik melalui bergolak hipersonik bereaksi dan arus non-bereaksi pada...
